Байкальская природная территория является лидером по количеству ограничений использования земельных участков, находящихся в ее пределах. Байкал включен в список всемирного наследия ЮНЕСКО, в 2006 году установлены Центральная экологическая зона, зона атмосферного влияния и буферная зона Байкальской природной территории.